首先做屋顶花园设计，严谨的第一步是要做：防水和排水 。屋顶花园设计基层的构造做法如果不恰当会直接影响到屋顶花园的质量，如荷载、防水、排水、植物种类的选择和存活率的多少等关键性问题。屋顶花园基层至少应该包括下面五个基本构造层，从下往上依次为防水层、排水层、过滤层、种植介质层。随着科技的发展，部份新技术的应用也使屋顶花园的基层产生了些许变化，但基本构造基本一致。
1、结构层
屋顶的结构主要是钢结构、混凝土结构、砖混结构和木结构等，同时屋顶的形式大致可分为坡屋顶和平屋顶，用钢或混凝土结构的大楼相比，木结构的建筑强度就要差点，只有少量的木结构建筑适合建造轻型屋顶花园，其构成要素也大多局限在草毯、小型盆栽、木质铺地、栏杆和藤架等。一般做家庭式的屋顶花园都是混凝土结构或砖混结构。 坡屋顶由于重力原因所导致的物品固定和保水等，也存在着诸多的限制因素，所以通常不太适合建造真正的屋顶花园。如果家里的屋顶呈坡度的小伙伴，做屋顶花园就要斟酌一下下了。
2、防水层
屋顶表面所使用的防水层，主要功能是防止水从外部渗入建筑物。由于布置在屋顶花园的下方，防水层还要可以防止一些植物根茎穿透。不做好这一切，等到花园竣工以后，如果有问题，那么很难找到漏水的准确位置，很可能就会拆除整个花园来进行防水层的维修工作，这样会给我们带来很大的麻烦和钱钱的浪费。所以呢必须保证防水层万无一失。无论是在材料方面还是在安装方面，都应该满足最高要求，这样后期才不会有诸多的难题出现。
3、防护层
为了防止防水层在施工期间受到伤害，需要在防水层的上方安装一层保护材料。这一材料必须是坚韧、结实而且耐用的，同时防护材料必须松散地铺设（而非紧密附着）在防水层的上方。国内通常采用柔软的灰沙、纸筋灰和油毡等做临时保护（其实主要功能是做隔离层）。
4、排水层
排水对于屋顶花园设计至关重要，排水出现问题可能导致植物死亡，并使水渗透到附近的住家，这样就会导致花很多钱钱来维修和清理工作。好的排水系统对于屋顶花园的维护和美观是十分必要的。而排水层只是屋顶花园排水系统的一个重要组成部份而已，另外，还有排水沟和排水管道，以及排水层上方的各层，比如种植层的类型、是否建有滤布层等，都直接影响排水系统的效能。
5、过滤层
多余的水分从种植层流入排水管道可能会夹杂一些土壤、护根物或植物残体，如果不对这些杂质加以过滤，那么不但种植层肥沃的土壤会随水流失，而且大楼的排水管道也会被堵塞。那后果是什么的严重！国内一般采用聚酯无纺布（土工布）作为过滤层，它有不同的厚度，能满足屋顶花园的不同需求，已经成为国内屋顶花园使用的一种标准材料。
6、种植介质层
由于屋顶的承重要求，所要选用的种植介质层应具有自重轻、不结块、保水保肥、适宜植物培育生长、施工简便和经济环保等性能。一般可选用种植土、草炭、膨胀岩石、细沙和经过发酵处理的动物粪便等材料，按一定比例混合配制而成。没有事可以到小区里收集落叶推积起来发酵一下就可以用。